Оба мяча в ворота чемпиона Эстонии влетели во втором тайме после розыгрыша стандартных положений.
К тому же гости не сумели реализовать в дебюте матча пенальти - удар Кирилла Нестерова отразил вратарь мальтийцев.
Ответный поединок состоится на "А Ле Кок Арене" 4 июля.