Энн Тарто родился 25 сентября 1938 года в Тарту. Уже с ранней юности, с 1950-х годов он посвятил себя восстановлению государственной независимости. За это его трижды отправляли в советские концлагеря, где он пробыл в общей сложности 14 лет. В последний раз Тарто освободился из советской тюрьмы в 1988 году.

Во время восстановления независимости Эстонии и в уже восстановленной Эстонской Республике он упорно работал на многих фронтах. Как общественный деятель и политик Энн Тарто включен в список ста наиболее выдающихся личностей Эстонии 20 века.

Энн Тарто награжден многими эстонскими и зарубежными знаками отличия.